Sancties moeten worden afgestemd op de juiste mensen en organisaties, terwijl de algemene bevolking zoveel mogelijk wordt gespaard. Om deze reden bevatten sanctieregelingen altijd uitzonderingen.
Bijvoorbeeld:
- in het geval van iemand met een visumverbod, kan een uitzondering worden verleend om dringende humanitaire redenen of omdat de persoon in kwestie gast is van een internationale organisatie in een bepaald land;
- uitzonderingen voor de levering en financiering van humanitaire goederen zoals voedsel en medicijnen;
- een uitzondering op een sectoraal import- / exportverbod door middel van een order, die ervoor zorgt dat bestaande contracten (contracten voor onbepaalde tijd of voor bepaalde tijd) nog steeds kunnen worden nageleefd;
- een speciale vergunning kan worden afgegeven aan een persoon of bedrijf op de sanctielijst, zodat deze aan reeds bestaande verplichtingen kan voldoen. Bijvoorbeeld het betalen voor geleverde goederen of het betalen van schadevergoeding;
- de gedeeltelijke opheffing van een wapenembargo om de invoer van niet-dodelijke uitrusting of materiaal voor humanitair gebruik, defensieve doelstellingen, crisisbeheersingsoperaties door de VN of de EU of mijnopruimingsoperaties mogelijk te maken;
- uitzonderingen die nodig zijn voor diplomatieke zaken. Dit maakt betalingen aan ambassades en internationale organisaties mogelijk.